《康熙微服私訪記2》沿襲該劇借古諷今、針貶時弊的新派古裝輕喜劇作品風格，分為“饅頭記”、“桂圓記”和“霞帔記”三個單元故事組成。“饅頭記”里講述康熙五十年，康熙（張國立飾）正值微服私訪時居然被當?shù)睾缽婒_進金礦做苦工；“桂圓記”發(fā)生在康熙五十一年，康熙抱病，宜妃（鄧婕飾）讓三德子（吳軍飾）請?zhí)t(yī)為其診治，病情反而加重。原來都是假藥作祟，康熙愈后出宮，嚴懲不法之徒；“霞帔記”里講述康熙五十二年，康熙大義滅親，整治裙帶關系。