在上一集中，愛(ài)麗絲（米拉·喬沃維奇 Milla Jovovich 飾）救出了被冷凍的同伴們，眾人在離開之際卻被趕來(lái)的雇傭兵趕盡殺絕。T病毒使紅皇后（Megan Charpentier 飾）的程序發(fā)生了錯(cuò)誤，變得殘暴嗜血的她想要?dú)⑺雷詈蟮娜祟悮绲厍颉Ｎㄒ荒軌蜃柚辜t皇后的只有愛(ài)麗絲一人。而此刻，失去了能力的愛(ài)麗絲卻被保護(hù)傘公司囚禁在位于海底的秘密基地中。威斯克（肖恩·羅伯茨 Shawn Roberts 飾）通過(guò)病毒侵入了保護(hù)傘公司的系統(tǒng)，他放走了愛(ài)麗絲并告訴她，她是人類最后的希望，而為了拯救人類，他們必須冰釋前嫌共同抵抗更強(qiáng)大的敵人。愛(ài)麗絲遇見(jiàn)了保護(hù)傘公司的前員工艾達(dá)王（李冰冰 飾），兩人一路上奮勇殺敵結(jié)下了深厚的友誼。